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      人工智(zhì)能结(jié)合医学影像(xiàng)助(zhù)力“狙击”疫情

      2020/04/11738

      人工智能结(jié)合(hé)医学影像(xiàng)领域助力“狙击”疫情(qíng)

      从春节前期武汉发现新(xīn)冠状病毒(dú)到(dào)现在(zài),已经(jīng)几个月过去了,我国(guó)疫情已(yǐ)经得(dé)到稳定控制,但是,新冠状病毒已经在全球各(gè)大地区(qū)蔓延,到目前为止(zhǐ),还在(zài)不断增加,感染的(de)国家在增加,感染人数也在不断增加,人数越来越(yuè)庞(páng)大。

      控制疫情刻不(bú)容缓(huǎn),大规模的筛查和检(jiǎn)测是防控的关键:包括(kuò)X射线和CT在内(nèi)的医(yī)学影像技术在抗击疫情的过程中起到了至关重要的作用(yòng),而人工智能则大幅度提升了医(yī)学影(yǐng)像工具(jù)的(de)能力和效(xiào)率。来自上海联影、上海大学、剑桥(qiáo)大学等(děng)机构(gòu)的(de)研(yán)究人(rén)员对AI结合医学影像(xiàng)领域在疫情(qíng)中的应用进行了回(huí)顾和(hé)总结,从无接触数据采集、工作流程重塑和(hé)定(dìng)量医学影像分析等方面(miàn)进行了阐述,展现了AI在抗击疫(yì)情过(guò)程中不可或缺的重要作用。

      基于医学影像的检测至关(guān)重要(yào)

      目(mù)前全球报(bào)告的疫(yì)情感(gǎn)染者已(yǐ)经超过150万(wàn)人,而有效的大规模检测(cè)是防控疫情的关(guān)键所在。目前广泛使用的是(shì)逆转(zhuǎn)录聚合酶链反应(RT-PCR,核酸检测),借助生物工程的强大能力成为了我(wǒ)国在抗(kàng)击疫情中的(de)有力武器。但RT-PCR方法却在世界上很多(duō)国(guó)家面临检(jiǎn)测试剂不足、检测能力不(bú)足的困扰,同时还受(shòu)到质量问题的(de)影响。不仅如此,还有(yǒu)研究表明,实验(yàn)中(zhōng)存在(zài)着(zhe)较(jiào)高(gāo)的假(jiǎ)阴性率。

      好在医务人员(yuán)在(zài)临(lín)床试验中利用的包括X和CT的医疗影像设备为肺炎的诊(zhěn)断提供(gòng)了有效帮助。我国(guó)的经验表明,如果(guǒ)在CT中观察(chá)到了肺部的相(xiàng)应(yīng)病理特征,很多病(bìng)例将会被认定为疑似病例,即使没有临(lín)床症状也要(yào)进行隔离(lí)。鉴于核酸检测(cè)的准确性仍待提高,疑似患者需要隔(gé)几天进行(háng)多次检测(cè)以(yǐ)确定诊断结果。这(zhè)时候,基于医(yī)学影像的手段在防控(kòng)病(bìng)毒传播的(de)过程中就发挥了(le)重要作用。

      以胸部CT为例,基(jī)于医学影像的疫情诊(zhěn)断流程通(tōng)常包(bāo)括(kuò)三个阶段(duàn),即扫描(miáo)前准备(bèi)、医学影像获取和(hé)分析诊断。人工智(zhì)能作为医学(xué)影像领域(yù)的新兴技(jì)术(shù),与高度依赖(lài)人工的传(chuán)统成像(xiàng)工作流程相比,可提供更安全、准确、高效的成像(xiàng)解决方案。在接下来的(de)报告中,有用于疫情的智能(néng)医学影像平台和工(gōng)作流程中(zhōng)流行的机器学习方法,以及一些公开(kāi)可用的数据集。

      人工智(zhì)能赋能(néng)无接触(chù)医学影像诊断(duàn)流程

      医务人员在抗击疫(yì)情的过程中冲在了第一线(xiàn),采集医学影像的过程(chéng)中不可避(bì)免地要(yào)接触(chù)潜在患者。传统的成像(xiàng)过程中(zhōng),患者需要在医务(wù)人员的帮助(zhù)下(xià)调整(zhěng)和(hé)定位身(shēn)体,协助患者摆好合适的姿势,在密切接(jiē)触过程中(zhōng)暴露在病毒下(xià)的(de)风险很高(gāo);相(xiàng)比之下,非接触(chù)式自动(dòng)成像工作流程可(kě)以(yǐ)将医患间的接触(chù)和感染风(fēng)险降低到最(zuì)小(xiǎo)。

      目前很(hěn)多X光和CT设备都配(pèi)备了(le)用于监护患者的摄像头,它们为非接触式(shì)的(de)医学影像(xiàng)采集提供了(le)设备基础。工作人(rén)员可以利用(yòng)摄(shè)像头观察和指导(dǎo)患(huàn)者的(de)位姿。但仅凭(píng)摄像头的(de)2D视角,研究人员(yuán)无(wú)法有效(xiào)判(pàn)断需要(yào)的测量范围(wéi)和扫描参数。这时候基于AI的(de)方法(fǎ)可以识别(bié)出患者的姿势和形状,而在算法(fǎ)的帮助(zhù)下(xià),RGB相机TOF传(chuán)感器(qì)等就能提(tí)供患者的姿态(tài)信息,以帮助医生确(què)定(dìng)最佳扫描参数——例如从图(tú)像中检测患者身(shēn)体(tǐ)关键(jiàn)点,包括颈部、肩膀、肘(zhǒu)部、脚踝(huái)、手腕(wàn)和膝盖等等。

      实践(jiàn)表明这(zhè)种方式可以有效减少不必要的(de)职业暴(bào)露。除了通过关(guān)键点和人(rén)体三维模型定义扫描(miáo)参数外,AI还可(kě)以对齐患(huàn)者与扫描中心、减小放射剂量(liàng)、提高成像质(zhì)量。此外,它还能使用基于参数化人(rén)体模型的方法来有效解决遮挡和关键点精度,有(yǒu)效推断出患者的(de)3D姿(zī)态。

      更准确的人体定位和(hé)参数化测量使(shǐ)准确、无接触的医学影(yǐng)像检测成为可能。下图展示了无接触影像采集的例(lì)子:

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      这是(shì)典(diǎn)型的无接触扫(sǎo)描(miáo)流程(chéng),是基(jī)于(yú)移动CT平台在AI的帮(bāng)助下实(shí)现自动化无接触影像采(cǎi)集的流程(chéng)。其中(zhōng)扫(sǎo)描室和控制室完全独立,避免了医务人员与患者的(de)不必要接触,患者(zhě)则在工(gōng)作人员视觉(jiào)监测和声音指导下调整姿势。同时,基(jī)于3D位姿估算和(hé)AI得到的网格模(mó)型,也可以估计患者身体(tǐ)部位、扫描范围和中(zhōng)心线,从而转换为控制(zhì)信(xìn)号的扫描参(cān)数。当然必要的时候(hòu),技术人(rén)员(yuán)还可以(yǐ)对参数(shù)进(jìn)行调整(zhěng)。在参(cān)数(shù)得到验证后,CT将(jiāng)患者对准设(shè)备(bèi)ISO中心并移入CT龙门进行扫描。采集CT图像后,在算法(fǎ)的(de)辅助下,医务(wù)人员(yuán)将对其进行处理和分析,以(yǐ)进行(háng)筛(shāi)查和诊断。

      AI赋(fù)能的医学(xué)影像处理

      目标(biāo)检测和分割是(shì)肺炎检测中的必要步骤。医生需要对胸部(bù)医学影像中的目标区域(包括肺部、肺叶、支(zhī)气管(guǎn)等位置和感染、病变区(qū)域(yù)的定位等)进(jìn)行(háng)描(miáo)绘,以支撑(chēng)后续的定量评估。目(mù)前的技术主(zhǔ)要是基于U-Net及(jí)其(qí)变体模型进行(háng)目标区域分割。下表展示了(le)目前应用于COVID-19分割的(de)深(shēn)度学习方法:

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      针对肺部(bù)区域(yù)和肺部(bù)病变进行检测和分割是研究的重点:一方面需(xū)要(yào)从医(yī)学影像中(zhōng)分离出肺部区(qū)域,同时还需要从(cóng)肺部区域中分离出病变区(qū)域。目前主要报道(dào)的文献中使用了最(zuì)为经(jīng)典(diǎn)的U-Net架构(gòu)以及更为复杂的U-Net++模型,还有包含残差结(jié)构(gòu)的V-Net和注(zhù)意(yì)力机制来(lái)获取更为(wéi)精细(xì)的肺部结构(gòu)和病变区域。

      但另一个问题是(shì),训练强大(dà)的分割(gē)网络需要充足的(de)标记数据,而在疫情中,通常还无法获得充(chōng)分的标(biāo)记数据。为解决这一问题,研究人(rén)员将人类知识结合到了检测流(liú)程(chéng)中。有的学者将人类决策放入了训练VB-net模型的闭(bì)环中,加入了放射科医生的交互(hù)。还有研究人员利用放射科医(yī)生给出的初始种(zhǒng)子(zǐ)来辅助(zhù)U-Net识别感(gǎn)染区域。此外,还有人(rén)使用(yòng)了包括注(zhù)意力机制和弱(ruò)监督学习的(de)方(fāng)法来(lái)进行(háng)训练。

      精确(què)的(de)感染区域分割可以对感染程度进行量化,让医生能更全面地了解(jiě)到有关患者病情(qíng)严重(chóng)程度的信息。同时(shí),提(tí)取肺部感(gǎn)染区域(yù)的特征也可对患者的住院时间和(hé)诊疗方案进行(háng)一(yī)定的辅助(zhù)预测。

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      AI辅助的诊断

      在(zài)获得了有效的医学影像后,需要专家来对病人的病情进行诊断。但在(zài)流行病爆发的当下,医疗资源(yuán)的严重匮乏使得准(zhǔn)确高效的诊断变得困难。不(bú)仅由于诊断需要花费(fèi)大量时间,还因(yīn)为疫情(qíng)与其他肺炎的(de)相似表现需要医生具有丰富的经(jīng)验(yàn)和诊断能力。而AI则(zé)可以辅(fǔ)助医生(shēng)对病人病情进行判断,实现更高效、更准确的诊断。

      X射线和CT影像都能为AI辅(fǔ)助诊断提供有效信息,其中(zhōng)包括X胸片中的异样、基于CT影像的新冠状病毒分(fèn)类以(yǐ)及(jí)与其他类似肺炎的区分,同(tóng)时还包括病情严重(chóng)性评估的辅助手段。下(xià)表展示(shì)了目前AI辅助诊断疫情的最新研(yán)究,涉及了病情分类、严重性评估等方面。

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      在AI辅助下,诊断的(de)精度(dù)和速度得以大幅提升,宝贵(guì)的医疗资(zī)源也(yě)可以得到有效利用。此外(wài),在病(bìng)程进展的后续研究,包括(kuò)肺部(bù)病变区域的变化与病程(chéng)的关系等方面,AI技术(shù)也为后续(xù)的治(zhì)疗以及(jí)疾病(bìng)规律的研究(jiū)提供了宝贵数据(jù)。

      新冠状病毒的相关数据集

      算法的开发(fā)和(hé)训(xùn)练离不开(kāi)数(shù)据的支撑

      一下是COVID-19 CT分割数据集,包(bāo)含60位(wèi)患者的100个轴切(qiē)面数据。

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      虽然这(zhè)些数(shù)据的数量和(hé)质量都还远远不能满(mǎn)足AI算(suàn)法的需求,但(dàn)随着人(rén)们(men)对于疫情的认(rèn)识和数据的汇(huì)总整理(lǐ),相信更多的数据会源源不断的被整理开放出来。

      在突如其来的新冠肺炎(yán)面前(qián),人工智(zhì)能在抗击疫情(qíng)中发挥出了重要的作用,也(yě)进一步显示了人工智能(néng)对于各个行业(yè)的重(chóng)要作用。相信拥有强有力(lì)的AI武器,我们将能更快的战胜病(bìng)魔,取得抗疫的(de)最终胜利!

      关键(jiàn)词:




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